Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAVIN4Q5BKX8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAVIN4Q5BKX8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms