Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNI3KQ59H18 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNI3KQ59H18 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms