Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KHDC3LQ587J8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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