Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ANKRD39Q53RE8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms