Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC38Q502W7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms