Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TWISTNBQ3B726 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TWISTNBQ3B726 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms