Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UVSSAQ2YD98 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms