Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ISXQ2M1V0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms