Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CDO1Q16878 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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CDO1Q16878 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CDO1Q16878 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CDO1Q16878 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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CDO1Q16878 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CDO1Q16878 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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