Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDKN3Q16667 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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