Protein–RNA interactions for Protein: Q16602

CALCRL, Calcitonin gene-related peptide type 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCRLQ16602 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CALCRLQ16602 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALCRLQ16602 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms