Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC6Q16204 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC6Q16204 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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