Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPTX1Q15818 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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