Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TWIST1Q15672 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms