Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SF1Q15637 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SF1Q15637 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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