Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TAF1CQ15572 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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