Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDSNQ15517 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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