Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SKIV2LQ15477 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SKIV2LQ15477 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms