Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A1Q15459 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A1Q15459 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3A1Q15459 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SF3A1Q15459 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3A1Q15459 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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