Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEC23BQ15437 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SEC23BQ15437 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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SEC23BQ15437 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SEC23BQ15437 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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