Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-204ENST00000465321 726 ntTSL 512.12□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 NUP205-207ENST00000489493 550 ntTSL 412.06□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-213ENST00000496932 779 ntTSL 312.04□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-210ENST00000479686 417 ntTSL 311.94□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CAMK2G-212ENST00000477205 1555 ntTSL 211.74□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SCAMP2-212ENST00000569904 858 ntTSL 511.46□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ELOVL1-202ENST00000413844 1451 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.587e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.627e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SCAMP2-202ENST00000562363 638 ntTSL 510.61□□□□□ -0.717e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CLASRP-212ENST00000588936 590 ntTSL 410.5□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.777e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC00174-210ENST00000638592 2261 ntTSL 510.15□□□□□ -0.787e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 URM1-201ENST00000372847 753 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.827e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TIAM2-211ENST00000528535 4404 ntTSL 29.83□□□□□ -0.848e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-210ENST00000507557 542 ntTSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.867e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CLASP2-202ENST00000333778 1989 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-211ENST00000507885 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.957e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.957e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 NT5DC3-203ENST00000447799 2172 ntTSL 29.06□□□□□ -0.967e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 DENND1A-204ENST00000394215 1380 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.977e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC00174-212ENST00000640964 4039 ntTSL 58.64□□□□□ -1.037e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MNX1-206ENST00000479817 169 ntTSL 1 (best)8.39□□□□□ -1.077e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MNX1-204ENST00000469500 209 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.077e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.147e-29■■■■■ 28
PCBP2Q15366 POM121C-201ENST00000398379 715 ntTSL 27.84□□□□□ -1.157e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 DDX27-203ENST00000471144 3639 ntTSL 1 (best)7.76□□□□□ -1.177e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ANKHD1-210ENST00000432301 3234 ntTSL 1 (best)7.6□□□□□ -1.195e-22■■■■■ 28
PCBP2Q15366 IRF2-209ENST00000512020 731 ntTSL 37.36□□□□□ -1.237e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ANKHD1-212ENST00000435794 3511 ntTSL 57.21□□□□□ -1.265e-22■■■■■ 28
PCBP2Q15366 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.267e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 AC019197.1-203ENST00000627211 815 ntTSL 57.08□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC01619-205ENST00000551563 1350 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ITFG1-210ENST00000567957 924 ntTSL 26.85□□□□□ -1.317e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ITFG1-211ENST00000568047 2636 ntTSL 56.84□□□□□ -1.317e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 CLASP2-216ENST00000485378 874 ntTSL 36.83□□□□□ -1.328e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC01619-210ENST00000553207 538 ntTSL 46.74□□□□□ -1.337e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.347e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.347e-29■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC00174-209ENST00000638517 4621 ntTSL 56.33□□□□□ -1.47e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ANKHD1-209ENST00000431508 4079 ntTSL 26.33□□□□□ -1.45e-22■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TIAM2-217ENST00000538270 642 ntTSL 46.3□□□□□ -1.48e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.47e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.21□□□□□ -1.427e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TIAM2-214ENST00000535231 550 ntTSL 46.06□□□□□ -1.448e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC01619-201ENST00000546975 1327 ntTSL 1 (best)5.97□□□□□ -1.457e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC00174-207ENST00000442578 1016 ntTSL 55.89□□□□□ -1.477e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC00174-211ENST00000639086 1016 ntTSL 55.89□□□□□ -1.477e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ANKHD1-211ENST00000433049 3649 ntTSL 55.86□□□□□ -1.475e-22■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.497e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 IRF2-206ENST00000507523 595 ntTSL 45.48□□□□□ -1.537e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.537e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PAFAH1B1-201ENST00000397193 1277 ntTSL 25.46□□□□□ -1.547e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ITFG1-202ENST00000537184 1422 ntTSL 25.44□□□□□ -1.547e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.557e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PAFAH1B1-209ENST00000574816 662 ntTSL 55.23□□□□□ -1.577e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC01619-208ENST00000552106 1402 ntTSL 1 (best)5.07□□□□□ -1.67e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 AC019197.1-204ENST00000629991 782 ntTSL 54.94□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.657e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.687e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 TIAM2-204ENST00000431620 388 ntTSL 44.36□□□□□ -1.718e-7■■■■■ 28
PCBP2Q15366 PAFAH1B1-212ENST00000609078 570 ntTSL 44.31□□□□□ -1.727e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 ITFG1-208ENST00000565262 584 ntTSL 33.89□□□□□ -1.797e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.987e-8■■■■■ 28
PCBP2Q15366 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.065e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 RFWD2-207ENST00000474194 975 ntTSL 324.14■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 RFWD2-203ENST00000367667 2034 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 RFWD2-210ENST00000498306 617 ntTSL 54.46□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 RFWD2-209ENST00000491600 773 ntTSL 54.35□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 TRIP12-208ENST00000430954 719 ntTSL 211.74□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.527e-7■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 GDPD5-205ENST00000527322 1000 ntTSL 1 (best)10.8□□□□□ -0.683e-19■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-207ENST00000445570 2690 ntTSL 218.82■□□□□ 0.63e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-210ENST00000483468 6069 ntTSL 216.85■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-216ENST00000529597 2468 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-211ENST00000484164 1312 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-209ENST00000478483 619 ntTSL 26.66□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-212ENST00000492787 795 ntTSL 56.25□□□□□ -1.413e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-215ENST00000529423 500 ntTSL 36.13□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 REPS1-218ENST00000530370 522 ntTSL 25.95□□□□□ -1.463e-8■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 WASHC4-201ENST00000311317 2897 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 27.9
PCBP2Q15366 WASHC4-208ENST00000550053 5819 ntTSL 57.33□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 27.9
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