Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IRF4Q15306 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF4Q15306 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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