Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ODF1Q14990 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms