Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMC1AQ14683 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
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