Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM53BQ14153 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms