Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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