Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL4BQ13620 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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