Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PEX6Q13608 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms