Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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FOXE3Q13461 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FOXE3Q13461 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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