Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STRN3Q13033 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms