Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ECH1Q13011 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ECH1Q13011 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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