Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSPB3Q12988 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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