Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
LMAN2Q12907 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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