Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CNTN1Q12860 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CNTN1Q12860 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CNTN1Q12860 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNTN1Q12860 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CNTN1Q12860 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CNTN1Q12860 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CNTN1Q12860 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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