Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMARCB1Q12824 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
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