Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMA1Q12791 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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KCNMA1Q12791 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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KCNMA1Q12791 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMA1Q12791 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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