Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCNA1Q09470 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms