Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD47Q08722 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD47Q08722 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD47Q08722 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD47Q08722 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CD47Q08722 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD47Q08722 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms