Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP1-1Q07627 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP1-1Q07627 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms