Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNDQ07001 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNDQ07001 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms