Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FMODQ06828 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FMODQ06828 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
FMODQ06828 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FMODQ06828 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms