Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PAX8Q06710 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms