Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms