Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRKCDQ05655 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms