Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
UBE3AQ05086 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms