Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN1Q04323 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms