Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TOP2BQ02880 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms