Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSC2Q02487 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DSC2Q02487 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms