Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CDK16Q00536 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms