Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK3Q00526 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms